Στο ΕΣΠΑ 2014-2020 της Περιφέρειας Κρήτης εντάχθηκαν έργα που αφορούν στην αποκατάσταση και ανάδειξη των 5 Εκκλησιών των Βυζαντινών και Μεταβυζαντινών χρόνων που βρίσκονται εντός του Εθνικού Δρυμού, κατά μήκος της διαδρομής του Φαραγγιού της Σαμαριάς το οποίο είναι αναγνωρισμένο από την UNESCO ως Απόθεμα της Βιόσφαιρας.
Στο πλαίσιο του έργου 350.000 ευρώ θα διατεθούν στην Εφορεία Αρχαιοτήτων Χανίων, όπωε αναφέρεται σε ανακοίνωση της Περιφέρειας.
Πρόκειται για πέντε μονόχωρους ναούς χρονολογημένους από τις αρχές του 14ου αιώνα (ο Ι. Ν. Οσίας Μαρίας Αιγυπτίας) μέχρι και τον 18ο (οι υπόλοιποι τέσσερις, δηλαδή οι Ι.Ν. των Αγ. Νικολάου, Αγ. Γεωργίου, Μεταμόρφωσης Σωτήρος και Αφέντη Χριστού). Για το σύνολο των εκκλησιών θα υλοποιηθεί δίγλωσση ψηφιακή εφαρμογή για κινητές συσκευές, η οποία θα διασυνδέσει τις εκκλησίες σε ενιαία εικονική διαδρομή (διαθέσιμη και για άτομα ΑΜΕΑ). Με το πέρας το έργου, οι ναοί θα παραδοθούν στατικά και μορφολογικά αποκατεστημένοι και ασφαλώς επισκέψιμοι, εντασσόμενοι αρμονικά στο φυσικό περιβάλλον της Σαμαριάς.
Επίσης έργα ανάδειξης συνολικού προϋπολογισμού 750.000 ευρώ θα πραγματοποιηθούν στο Μινωϊκό Ανακτορικό Κέντρο της Ζωμίνθου στον Ψηλορείτη. Συγκεκριμένα 400.000 ευρώ θα διατεθούν στην Εφορεία Αρχαιοτήτων Ρεθύμνου για τη Μινωϊκή Ζώμινθο που βρίσκεται εντός του Γεωπάρκου UNESCO του Ψηλορείτη, στα 1200 μέτρα υψόμετρο, για την προστασία, ανάδειξη και προβολή του αρχαιολογικού χώρου, καθώς και την κατασκευή των απαραίτητων υποδομών προκειμένου να καταστεί ασφαλώς επισκέψιμος.