Να παραμείνουν εκτός Μητρώου κινδυνεύουν οι αγροτικοί συνεταιρισμοί, των οποίων ο κύκλος εργασιών τους σε βάθος τριετίας, δεν ξεπερνά τα 30.000 ευρώ, σύμφωνα με τροποποιητική απόφαση που υπεγράφη από τον υπουργό Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων, Βαγγέλη Αποστόλου.
Σύμφωνα με την εν λόγω απόφαση, το παραπάνω ποσό, μειώνεται στις 10.000 ευρώ σε ότι έχει να κάνει με τους γυναικείους συνεταιρισμούς, τους συνεταιρισμούς βιολογικών προϊόντων, τους συνεταιρισμούς σε νησιά εκτός Κρήτης και Εύβοιας όπως και για τους συνεταιρισμούς σε ορεινές περιοχές.
Εκτός κινδυνεύουν να μείνουν και οι συνεταιριστικές οργανώσεις (ΑΣ, ΚΑΣ, ΚΕΑΣ, ΑνΣ, ΕΑνΣ και ΑΕΣ) όταν δεν υποβάλλουν οικονομικές καταστάσεις τριών συνεχόμενων διαχειριστικών χρήσεων, για έξι μήνες.
